160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1600 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  100 
 
 
359 aa  735    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  83.52 
 
 
357 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  52.01 
 
 
353 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  51.15 
 
 
353 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  53.39 
 
 
360 aa  360  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  53.01 
 
 
348 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  52.72 
 
 
348 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  51.86 
 
 
348 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  49.86 
 
 
348 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  50 
 
 
351 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  51.86 
 
 
348 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  49.71 
 
 
353 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  51.86 
 
 
348 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  53.01 
 
 
357 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  52.42 
 
 
351 aa  339  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  47.9 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  50.14 
 
 
351 aa  334  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  50 
 
 
349 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  49.28 
 
 
360 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  50.14 
 
 
351 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  50.14 
 
 
351 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  49.86 
 
 
351 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  47.98 
 
 
351 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  48 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  46.96 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  44.25 
 
 
357 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  44.28 
 
 
343 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  38.12 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  37.24 
 
 
357 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  33.43 
 
 
356 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  33.43 
 
 
356 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
360 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
360 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  35.74 
 
 
341 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  36.64 
 
 
369 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  36.07 
 
 
376 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
344 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
355 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
355 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
355 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  33.13 
 
 
380 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  34.71 
 
 
353 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
365 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
356 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  31.32 
 
 
365 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  35.27 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
356 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
360 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
363 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  30.83 
 
 
416 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
355 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  33.22 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.45 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
366 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.73 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
187 aa  59.3  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
234 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
285 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
271 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  33.63 
 
 
363 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  30 
 
 
281 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.21 
 
 
229 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
285 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
285 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
268 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
173 aa  49.7  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  26.67 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  30.06 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  27.68 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
276 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  28.31 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  31.28 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
439 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
179 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
283 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.19 
 
 
447 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.25 
 
 
287 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
260 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
283 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.17 
 
 
259 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  31.68 
 
 
400 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 
537 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
235 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  26.79 
 
 
246 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  29.13 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.68 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  26.72 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.1 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>