25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1069 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  77.5 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  67.5 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  62.79 
 
 		 351 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  62.79 
 
 		 353 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  60.47 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  62.79 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  60.47 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  62.5 
 
 		 350 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  39.53 
 
 		 351 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  62.5 
 
 		 343 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  55.81 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  60 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  60 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  60 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  60 
 
 		 353 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  55 
 
 		 360 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  60 
 
 		 351 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  62.79 
 
 		 348 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  55.81 
 
 		 348 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  60.47 
 
 		 348 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  58.14 
 
 		 348 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  58.14 
 
 		 348 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  47.5 
 
 		 357 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>