178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2188 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 343 aa  690    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  65.59 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  60.59 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  64.04 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  52.79 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  51.91 
 
 		 351 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  51.91 
 
 		 351 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  51.91 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  51.5 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  48.97 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  48.96 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  48.38 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  48.54 
 
 		 350 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  45.72 
 
 		 351 aa  315  9e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  48.67 
 
 		 353 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 353 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  48.83 
 
 		 351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  47.66 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  47.66 
 
 		 348 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  42.27 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  43.7 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  42.52 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  44.28 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  44.71 
 
 		 348 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  42.23 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  35.15 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  34.85 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  37.34 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.93 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  31.56 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  31.31 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  31.31 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.96 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  30.57 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  31.15 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31 
 
 		 380 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  28.37 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  33 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  62.5 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 276 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  31.36 
 
 		 184 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 274 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  31.63 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.31 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  28.91 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  22.65 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  23.68 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  22.43 
 
 		 205 aa  49.3  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  29.28 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.74 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.27 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  45 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  29.31 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  30 
 
 		 187 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  22.47 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  43.08 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.94 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.71 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.62 
 
 		 434 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  35.21 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>