More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4899 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  98.71 
 
 		 541 aa  1110    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 541 aa  1122    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  98.71 
 
 		 541 aa  1111    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  98.52 
 
 		 541 aa  1108    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  97.41 
 
 		 541 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  81.85 
 
 		 248 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  81.85 
 
 		 248 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  81.85 
 
 		 248 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 		 248 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  72.18 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  71.77 
 
 		 248 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  72.18 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  70.97 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  71.37 
 
 		 248 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  71.37 
 
 		 248 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  70.16 
 
 		 248 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  71.37 
 
 		 248 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  70.16 
 
 		 248 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  72.98 
 
 		 254 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  70.16 
 
 		 248 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  70.56 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  70.56 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  69.35 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  68.95 
 
 		 248 aa  363  3e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  70.97 
 
 		 248 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  68.95 
 
 		 248 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  62.5 
 
 		 248 aa  333  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  46.53 
 
 		 249 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  33.87 
 
 		 275 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 254 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 245 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  29.48 
 
 		 227 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 277 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  39.22 
 
 		 280 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  39.22 
 
 		 280 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  38.16 
 
 		 293 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 280 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  29.72 
 
 		 247 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  23.87 
 
 		 273 aa  87.4  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  26.69 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.17 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.17 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.06 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  35.51 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 266 aa  67  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 276 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  25.55 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  25.55 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  26.37 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.03 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  25.25 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25.24 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.47 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.4 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.29 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  25.63 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  30.4 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 		 239 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.09 
 
 		 275 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 230 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.09 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33.05 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.41 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  35.8 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  25.37 
 
 		 239 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  35.8 
 
 		 236 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 675 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 248 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.89 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 252 aa  62  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  34.57 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 		 230 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 251 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 190 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  25.37 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  23.66 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.09 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  29.88 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.08 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.168902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>