121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3509 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  91.13 
 
 		 248 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  91.53 
 
 		 248 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  88.71 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  87.9 
 
 		 248 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  87.5 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  87.5 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  85.08 
 
 		 248 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  82.26 
 
 		 248 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  82.66 
 
 		 248 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  82.26 
 
 		 248 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  81.45 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  85.08 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  80.65 
 
 		 248 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  79.44 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  80.24 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  79.84 
 
 		 248 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  81.05 
 
 		 248 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  72.98 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  72.98 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  72.98 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  72.58 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  72.58 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  72.98 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  67.34 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  45.71 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  33.06 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  30.36 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  26.89 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  25.86 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  37.04 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  33.87 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  48.57 
 
 		 398 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  41.89 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.57 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.88 
 
 		 429 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  35.53 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  34.18 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.28 
 
 		 415 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.91 
 
 		 485 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  28.49 
 
 		 414 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.66 
 
 		 422 aa  48.9  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 344 aa  48.5  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  28.49 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.19 
 
 		 420 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  28.49 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  28.49 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  28.49 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  28.49 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.66 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.39 
 
 		 447 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.81 
 
 		 419 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  44.12 
 
 		 417 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.81 
 
 		 419 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  32.41 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0031  hypothetical protein  39.44 
 
 		 328 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.31 
 
 		 415 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.11 
 
 		 398 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  32.05 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  31.65 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.19 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  28.87 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  37.14 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  32.05 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  35.71 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3991  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.56 
 
 		 428 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000734624  normal  0.0404434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  34.67 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  27.78 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  38.33 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  38.33 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.81 
 
 		 418 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  38.33 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.41 
 
 		 440 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>