91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5271 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  52.94 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  41.06 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  43.59 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  35.81 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  29.87 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  32.51 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  31.8 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  29.74 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  28.88 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  31.03 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  28.88 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  28.85 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  28.45 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  28.45 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  31.6 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  28.02 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  28.02 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  28.5 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.5 
 
 		 541 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.5 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.5 
 
 		 541 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.02 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  31.03 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  30.14 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  29.73 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2239  hypothetical protein  28 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00467151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1993  hypothetical protein  27.2 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0193266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2199  hypothetical protein  28 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1975  hypothetical protein  26.4 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  36.72 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  31.93 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  32.49 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2184  hypothetical protein  26.4 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2024  hypothetical protein  25.6 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211768  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2178  hypothetical protein  25.6 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37585  predicted protein  31.11 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 360 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  25 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1892  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.83 
 
 		 424 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26.83 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.11 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0427  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  41.03 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.68 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0766  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase protein  33.67 
 
 		 406 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.159603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  19.73 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2012  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0990636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  36.71 
 
 		 360 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0740  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.73 
 
 		 404 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1900  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  32.77 
 
 		 403 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0540  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.89 
 
 		 419 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109012  normal  0.39932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.71 
 
 		 411 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0585  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.89 
 
 		 419 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  25 
 
 		 360 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  22.55 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.21 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 353 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 244 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 240 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1851  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 236 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 276 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>