191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2474 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  47.13 
 
 
275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  42.92 
 
 
227 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  33.2 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  32.13 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  32.81 
 
 
248 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  32.81 
 
 
248 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  31.71 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  31.73 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  31.73 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
248 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  31.71 
 
 
248 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  28.86 
 
 
541 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 
248 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.86 
 
 
541 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.86 
 
 
541 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
248 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  30.12 
 
 
248 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
248 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  30.12 
 
 
248 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.86 
 
 
541 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.46 
 
 
541 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  30.24 
 
 
248 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  32.95 
 
 
254 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  29.44 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  31.33 
 
 
254 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  30.04 
 
 
248 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  28.05 
 
 
248 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  29.67 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  29.32 
 
 
248 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  32.4 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  25.23 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  27.16 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.71 
 
 
482 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  26.14 
 
 
387 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  26.14 
 
 
387 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  26.14 
 
 
387 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.85 
 
 
434 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  27.49 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
390 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
391 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  24.05 
 
 
391 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  24 
 
 
390 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  39.29 
 
 
419 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 
494 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.89 
 
 
390 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.89 
 
 
390 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35 
 
 
457 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.28 
 
 
394 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  32.63 
 
 
394 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.51 
 
 
423 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.28 
 
 
394 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
332 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
419 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
419 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.14 
 
 
392 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.55 
 
 
390 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
395 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.63 
 
 
420 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0148  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.85 
 
 
424 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
420 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1917  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.39 
 
 
424 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0513783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
390 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.01 
 
 
390 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.78 
 
 
421 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3438  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.55 
 
 
390 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.18 
 
 
398 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2662  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  39.24 
 
 
371 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.360692  normal  0.0481393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  35.8 
 
 
423 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  30.53 
 
 
394 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.03 
 
 
412 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.78 
 
 
409 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
390 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1678  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 
398 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2162  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
397 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.125639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.03 
 
 
413 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
392 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3991  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.27 
 
 
428 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000734624  normal  0.0404434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0967  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.25 
 
 
446 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  normal  0.0206245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.35 
 
 
419 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  39.24 
 
 
422 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.62 
 
 
447 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07040  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
489 aa  49.3  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.237477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.35 
 
 
420 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07375  conserved hypothetical protein  23.88 
 
 
510 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0295  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.23 
 
 
389 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.73 
 
 
415 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0397  cyclopropane fatty acid synthase family protein  25.23 
 
 
389 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
394 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2488  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.13 
 
 
406 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697933  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1109  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
402 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165958  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.75 
 
 
419 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
395 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.33 
 
 
394 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
431 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2617  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.16 
 
 
406 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>