126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3046 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  88.71 
 
 		 248 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  88.31 
 
 		 248 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  87.9 
 
 		 248 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  87.1 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  87.1 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  84.27 
 
 		 248 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  84.68 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  88.31 
 
 		 254 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  83.47 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  79.84 
 
 		 248 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  79.44 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  78.63 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  78.63 
 
 		 248 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  78.23 
 
 		 248 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  75.81 
 
 		 248 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  72.58 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  72.18 
 
 		 541 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  72.58 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 		 541 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  72.58 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  72.58 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  76.61 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  71.77 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  76.61 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  68.15 
 
 		 248 aa  354  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  45.31 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  32.81 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  29.55 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  28.3 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  28.31 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  32.26 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.75 
 
 		 420 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  32.76 
 
 		 422 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  32.1 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.15 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  36 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.9 
 
 		 457 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 344 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.11 
 
 		 398 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.88 
 
 		 429 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  43.4 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.66 
 
 		 422 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  39.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.11 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.06 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 		 485 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.45 
 
 		 431 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.18 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 395 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.51 
 
 		 447 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 415 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  27.46 
 
 		 348 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.75 
 
 		 417 aa  45.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 		 428 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 440 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 363 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 		 418 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3991  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.73 
 
 		 428 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000734624  normal  0.0404434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  30.61 
 
 		 776 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  32.77 
 
 		 419 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.97 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.97 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0031  hypothetical protein  39.44 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.58 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.36 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.48 
 
 		 494 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.67 
 
 		 424 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1317  hypothetical protein  30.65 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 1759 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.61 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.9 
 
 		 428 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  28.12 
 
 		 121 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 572 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 		 394 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4997  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 431 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.5 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>