86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3211 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  87.5 
 
 
248 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  86.69 
 
 
248 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  84.68 
 
 
248 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  85.08 
 
 
248 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  83.47 
 
 
248 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  83.47 
 
 
248 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  83.47 
 
 
248 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  83.87 
 
 
254 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  80.65 
 
 
248 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  80.24 
 
 
248 aa  407  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  78.63 
 
 
248 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  77.42 
 
 
248 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  79.03 
 
 
248 aa  401  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  79.44 
 
 
248 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  78.63 
 
 
248 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  72.58 
 
 
541 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  72.98 
 
 
541 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  72.58 
 
 
541 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  77.02 
 
 
248 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 
541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  72.18 
 
 
541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  72.18 
 
 
248 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  72.18 
 
 
248 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  72.18 
 
 
248 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  77.02 
 
 
248 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  67.34 
 
 
248 aa  349  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  47.35 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  36.73 
 
 
275 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  31.85 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  33.07 
 
 
245 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  31.17 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  27.23 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  38.27 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  26.25 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  25.73 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  35.53 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  36.71 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  30.43 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.34 
 
 
422 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  41.51 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
344 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
271 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0031  hypothetical protein  39.44 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  30 
 
 
211 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
301 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.19 
 
 
420 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  44.29 
 
 
398 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.89 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.84 
 
 
429 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
431 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.99 
 
 
398 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  43.55 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.52 
 
 
424 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
392 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.65 
 
 
417 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  29.27 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  27.84 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  40 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.78 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  40 
 
 
414 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  40 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  40 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  40 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2575  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.72 
 
 
383 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.83 
 
 
415 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  40 
 
 
342 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
363 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.58 
 
 
485 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1682  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.35 
 
 
383 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 
438 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  31.67 
 
 
219 aa  42  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3991  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.58 
 
 
428 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000734624  normal  0.0404434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
231 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  25.64 
 
 
258 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
328 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.67 
 
 
447 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32792  predicted protein  33.77 
 
 
252 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>