64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0341 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  99.69 
 
 
342 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4568  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
327 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  27.88 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  39.76 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  48.21 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  46.88 
 
 
248 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  46.88 
 
 
248 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  45.31 
 
 
248 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  40.58 
 
 
292 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  35.35 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  35.35 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  43.84 
 
 
248 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  45.31 
 
 
248 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3704  methyltransferase type 12  23.81 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.486268  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2014  hypothetical protein  23.41 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0593301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1994  hypothetical protein  23.41 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0825004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2150  hypothetical protein  23.41 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  38.03 
 
 
541 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  38.03 
 
 
541 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  38.03 
 
 
541 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  38.03 
 
 
541 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  42.11 
 
 
295 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  45.45 
 
 
319 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  45.45 
 
 
248 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  36 
 
 
165 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.94 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  32.86 
 
 
289 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.48 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  41.1 
 
 
248 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  33.11 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  25.15 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 
541 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  30.17 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  40.62 
 
 
248 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.85 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  38.98 
 
 
248 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.85 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  37.5 
 
 
274 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  24.4 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.71 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 
248 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
258 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
254 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.45 
 
 
296 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
309 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  27.06 
 
 
363 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.71 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  29.92 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
275 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
295 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  40 
 
 
248 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
293 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  32.53 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.82 
 
 
295 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>