209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2143 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  81.45 
 
 		 248 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  79.84 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  80.65 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  80.65 
 
 		 248 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  78.23 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  78.23 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  77.42 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  77.02 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  76.61 
 
 		 248 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  77.02 
 
 		 248 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  75.4 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  74.19 
 
 		 248 aa  390  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  71.37 
 
 		 541 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  76.21 
 
 		 254 aa  381  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  71.37 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  71.37 
 
 		 541 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  78.63 
 
 		 248 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  71.37 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  70.97 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  71.37 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  71.37 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  71.37 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  68.15 
 
 		 248 aa  348  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  48.57 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  34.84 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  29.67 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  27.71 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  32.09 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  38.27 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.34 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 419 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 419 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.25 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 		 447 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.81 
 
 		 415 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 		 485 aa  52  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.95 
 
 		 422 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.4 
 
 		 424 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  31.9 
 
 		 394 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.83 
 
 		 431 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  29.03 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 344 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  32.22 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.9 
 
 		 394 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 429 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  31.65 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.44 
 
 		 417 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.64 
 
 		 398 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  26.14 
 
 		 343 aa  48.9  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  43.84 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  43.84 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  43.84 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  43.84 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  43.84 
 
 		 342 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  43.84 
 
 		 414 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 285 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 363 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  34.43 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  31.9 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3579  methyltransferase  27.2 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0715591 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4825  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 419 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 420 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  33.33 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2162  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.89 
 
 		 397 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.125639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.65 
 
 		 408 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.9 
 
 		 423 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.23 
 
 		 415 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 392 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  29.52 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.11 
 
 		 398 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5037  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.76 
 
 		 422 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>