218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0233 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  47.13 
 
 
245 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  40.66 
 
 
227 aa  198  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  36.95 
 
 
248 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 
541 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  34.14 
 
 
541 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  33.87 
 
 
541 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  33.87 
 
 
541 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  33.87 
 
 
541 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  35.08 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  35.08 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  35.39 
 
 
248 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  35.39 
 
 
248 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  35.39 
 
 
248 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  35.1 
 
 
248 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  34.57 
 
 
248 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  34.98 
 
 
248 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  33.06 
 
 
248 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  34.57 
 
 
248 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  35.86 
 
 
248 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  34.43 
 
 
248 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
248 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  34.84 
 
 
248 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  33.88 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  33.6 
 
 
254 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  34.98 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  30.24 
 
 
254 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  26.37 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  24.67 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  26.84 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  34.09 
 
 
419 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
420 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2709  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.47 
 
 
417 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
391 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01431  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.67 
 
 
410 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.42 
 
 
419 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.42 
 
 
419 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1441  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.08 
 
 
419 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.351858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  27.1 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1310  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  41.38 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1116  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  30.95 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.71 
 
 
420 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4467  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  36.89 
 
 
400 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5037  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.97 
 
 
422 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.62 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  34.62 
 
 
394 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  38.67 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  33.71 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.76 
 
 
413 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3190  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
421 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02620  L-isoaspartate protein carboxylmethyltransferase  35.85 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1620  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.77 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  34.62 
 
 
394 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.76 
 
 
420 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81203  predicted protein  29.9 
 
 
507 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.62 
 
 
398 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  31 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.44 
 
 
434 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1175  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
421 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38592  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.41 
 
 
418 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3063  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.07 
 
 
418 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1314  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.07 
 
 
428 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.393675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.05 
 
 
427 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3049  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.07 
 
 
418 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1128  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  39.77 
 
 
388 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.34 
 
 
457 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3206  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.07 
 
 
428 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2068  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.52 
 
 
218 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2155  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.52 
 
 
218 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.5 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0956  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.36 
 
 
422 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.753631  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.5 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.88 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.76 
 
 
428 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1109  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.39 
 
 
402 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165958  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5830  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35 
 
 
405 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1147  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 
442 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
403 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  40.51 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.34 
 
 
445 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
390 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
390 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1335  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.98 
 
 
400 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
427 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.921237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3928  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.83 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
269 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.06 
 
 
417 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.66 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.55 
 
 
387 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2838  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.83 
 
 
409 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>