99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  44.07 
 
 
251 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  40.24 
 
 
257 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  43.59 
 
 
254 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  31.3 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  27.16 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  27.16 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  27.59 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  25.97 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  26.72 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  26.41 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  26.72 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  28.46 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  28.33 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  27.39 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  25.43 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  25.11 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  26.72 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  24.57 
 
 
541 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  24.57 
 
 
541 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  24.57 
 
 
541 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  24.57 
 
 
541 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  24.14 
 
 
541 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  25.65 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  22.98 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  25.54 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  27.49 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
390 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
254 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.79 
 
 
420 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.32 
 
 
390 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0279  methoxy mycolic acid synthase 2  26.95 
 
 
311 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.42 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3438  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.32 
 
 
390 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  37.84 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.43 
 
 
390 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.43 
 
 
390 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1158  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase-like protein  26.95 
 
 
311 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2786  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.95 
 
 
311 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2940  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.95 
 
 
311 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.96 
 
 
413 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2907  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  38.98 
 
 
414 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.43 
 
 
390 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.43 
 
 
390 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  35.53 
 
 
342 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  26.83 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  35.53 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  35.53 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  35.53 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  35.53 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0397  cyclopropane fatty acid synthase family protein  27.43 
 
 
389 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0766  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase protein  28.32 
 
 
406 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.159603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0295  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.43 
 
 
389 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.85 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.38 
 
 
406 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.84 
 
 
471 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.7 
 
 
416 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
391 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  31.08 
 
 
580 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  38.33 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  42.86 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  30.69 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.38 
 
 
406 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  31.87 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  29.2 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.13 
 
 
411 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
209 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  30.33 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
363 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  35.56 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  29.01 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0788  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.14 
 
 
412 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 
594 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  42.11 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  41.82 
 
 
317 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
195 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  35.34 
 
 
198 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  33.94 
 
 
291 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.25 
 
 
295 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
271 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
265 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  31.34 
 
 
189 aa  42  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>