214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04172 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  82.26 
 
 		 541 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  82.26 
 
 		 541 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  82.66 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  81.85 
 
 		 541 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  82.26 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  74.6 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  72.58 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  73.39 
 
 		 248 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  73.79 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  72.98 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  71.77 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  72.18 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  71.77 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  73.39 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  72.18 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  72.18 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  72.98 
 
 		 254 aa  370  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  70.97 
 
 		 248 aa  367  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  71.37 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  71.77 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  64.92 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  48.16 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  34.68 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  35.39 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  30.12 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  29.39 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  28.38 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  26.72 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.76 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.67 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.5 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.66 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.66 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 494 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  33.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.2 
 
 		 420 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5037  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.84 
 
 		 422 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  25.36 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.43 
 
 		 428 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.53 
 
 		 485 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 419 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 419 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  28.64 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  34.04 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.36 
 
 		 440 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  30.52 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  27.59 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3991  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.89 
 
 		 428 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000734624  normal  0.0404434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0777  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.1 
 
 		 442 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.71 
 
 		 422 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  25 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  41.82 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.02 
 
 		 417 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.29 
 
 		 419 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1283  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.2 
 
 		 440 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  35.35 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 431 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  35.35 
 
 		 414 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  35.35 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  35.35 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  35.35 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  35.35 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3379  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 		 418 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.06 
 
 		 415 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.68 
 
 		 482 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.92 
 
 		 396 aa  49.3  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  28.74 
 
 		 422 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.26 
 
 		 434 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2709  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 417 aa  48.5  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1147  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.39 
 
 		 442 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  27.78 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0451  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.44 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.921237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2575  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.97 
 
 		 383 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.17 
 
 		 418 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.7 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.7 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.91 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.52 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  27.33 
 
 		 419 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  27.75 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  28.45 
 
 		 394 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.21 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.7 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>