186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3127 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  82.26 
 
 		 248 aa  427  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  80.65 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  81.45 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  79.84 
 
 		 248 aa  417  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  80.24 
 
 		 248 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  79.44 
 
 		 248 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  80.24 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  79.03 
 
 		 248 aa  407  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  79.03 
 
 		 248 aa  407  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  77.02 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  78.63 
 
 		 248 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  81.45 
 
 		 248 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  80.65 
 
 		 248 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  77.42 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  73.79 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  73.79 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  73.79 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  77.02 
 
 		 254 aa  380  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  70.16 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  69.76 
 
 		 541 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  69.76 
 
 		 541 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  69.76 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  69.35 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  67.34 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  48.16 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  35.08 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  31.33 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  28.98 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  28.84 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  29.54 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  32.5 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.66 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  35.8 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.83 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.67 
 
 		 485 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.29 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.23 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.04 
 
 		 420 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 344 aa  52  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  47.06 
 
 		 417 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.48 
 
 		 398 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  45.28 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  45.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0963  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.13 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.99 
 
 		 398 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  32.05 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.27 
 
 		 396 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.46 
 
 		 415 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.27 
 
 		 435 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000137884  hitchhiker  0.000179759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 419 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.58 
 
 		 419 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.58 
 
 		 419 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  30.09 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0781  hypothetical protein  26.8 
 
 		 121 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.069115  normal  0.0215827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  25.2 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0788  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 412 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.73 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 		 415 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.38 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2293  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.36 
 
 		 414 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000690855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.89 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.03 
 
 		 394 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  29.41 
 
 		 423 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3579  methyltransferase  26.4 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0715591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  30.17 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1917  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.96 
 
 		 424 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0513783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.54 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.82 
 
 		 424 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.52 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  30.61 
 
 		 776 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3479  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.3 
 
 		 413 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.93 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.11 
 
 		 420 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.18 
 
 		 438 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.58 
 
 		 408 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2575  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.86 
 
 		 383 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.24 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.24 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  38.24 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>