258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2084 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  52.94 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  44.07 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  41.11 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  30.54 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  28.39 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  28.39 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  27.54 
 
 		 541 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.54 
 
 		 541 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.12 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  30.51 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.39 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  29.54 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  30.59 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.69 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  32.72 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  28.39 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  28.39 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  28.3 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  28.93 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  28.39 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  28.31 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  29.24 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  26.69 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  28.81 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.78 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.35 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  24.67 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  37.65 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  29.93 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  36.96 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.29 
 
 		 442 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.86 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.21 
 
 		 415 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  26.7 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  37.04 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3438  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.39 
 
 		 390 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.62 
 
 		 485 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  30.18 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  30.18 
 
 		 341 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.51 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.91 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 353 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2162  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.98 
 
 		 397 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.125639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  53.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.91 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.51 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1109  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.85 
 
 		 402 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.92 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  30.18 
 
 		 341 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  22.9 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.59 
 
 		 390 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.59 
 
 		 390 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.51 
 
 		 471 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 363 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.98 
 
 		 390 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.57 
 
 		 429 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.14 
 
 		 420 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  33.97 
 
 		 411 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.59 
 
 		 390 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.79 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0585  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.04 
 
 		 419 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.48 
 
 		 426 aa  48.5  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.48 
 
 		 426 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.79 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.27 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.29 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.14 
 
 		 394 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  32 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  26.5 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  41.89 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.25 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.87 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2488  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.98 
 
 		 406 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697933  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2593  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.98 
 
 		 406 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.604704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1958  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.98 
 
 		 406 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>