144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1076 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  506  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  84.27 
 
 		 248 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  83.47 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  83.87 
 
 		 248 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  83.87 
 
 		 248 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  83.06 
 
 		 248 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  82.66 
 
 		 248 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  81.45 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  79.03 
 
 		 248 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  80.24 
 
 		 248 aa  407  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  81.85 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  77.02 
 
 		 248 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  75.81 
 
 		 248 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  76.21 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  76.61 
 
 		 248 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  77.02 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  71.77 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  71.77 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  71.77 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  70.56 
 
 		 541 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  70.56 
 
 		 541 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  70.56 
 
 		 541 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  77.42 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  70.16 
 
 		 541 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  70.16 
 
 		 541 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  64.92 
 
 		 248 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  46.12 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  29.44 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  29.25 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  29.74 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.99 
 
 		 422 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.78 
 
 		 447 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 485 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.47 
 
 		 431 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.93 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  33.33 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.05 
 
 		 398 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 344 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  28.98 
 
 		 414 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  45.31 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  45.31 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  45.31 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  45.31 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  44.78 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  45.31 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.76 
 
 		 428 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 1759 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  32.91 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2392  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.76 
 
 		 420 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 		 429 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.76 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.77 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0493  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.23 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.462479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.63 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5037  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0881732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.5 
 
 		 398 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  29.27 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  30.17 
 
 		 423 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0031  hypothetical protein  42.25 
 
 		 328 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 277 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  29.69 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  22.83 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  23.33 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.19 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.45 
 
 		 419 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.77 
 
 		 424 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  29.31 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26.81 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  36.9 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.06 
 
 		 418 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>