More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0889 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  53.04 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  48.18 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  47.33 
 
 		 464 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  43.95 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  39.59 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  39.11 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  37.86 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  40.56 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  39.83 
 
 		 390 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 390 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 390 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 391 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 398 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 392 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 392 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.76 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  33.76 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  47.92 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.85 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  37.96 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  36.52 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  36.36 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  26.53 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  26.53 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  27.14 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  32.56 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.34 
 
 		 414 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 382 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.87 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  30 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  34.91 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  27.67 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.68 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.56 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  27.63 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  36.7 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.11 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.83 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.48 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.24 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.44 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  26.18 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.4 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.91 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.95 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>