211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0671 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  100 
 
 
312 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.78 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  34.38 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.27 
 
 
237 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.54 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.65 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.62 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.75 
 
 
231 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40 
 
 
233 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  31.78 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.85 
 
 
228 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 
253 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
249 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.63 
 
 
233 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.26 
 
 
232 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.63 
 
 
237 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 
228 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  37.68 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 
232 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  30.46 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.56 
 
 
237 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  28 
 
 
234 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  35.29 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1604  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.654755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.91 
 
 
226 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.01 
 
 
248 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
282 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  22.6 
 
 
234 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.54 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
1759 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  32.53 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  34.78 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  34.78 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  34.78 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  35.71 
 
 
259 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.58 
 
 
232 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.55 
 
 
403 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
235 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.43 
 
 
237 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
217 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  30.34 
 
 
228 aa  49.7  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  26 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
249 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  37.35 
 
 
250 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
279 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  26.59 
 
 
232 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.64 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.21 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.48 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.84 
 
 
190 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5830  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.81 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  23.29 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.43 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.04 
 
 
230 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
251 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.7 
 
 
250 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.28 
 
 
255 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.36 
 
 
233 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  37.68 
 
 
252 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.7 
 
 
225 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  33.33 
 
 
221 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.89 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>