75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1585 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  534  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  38.75 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
249 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
253 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
250 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  36.68 
 
 
261 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  35.15 
 
 
264 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  35.1 
 
 
327 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.98 
 
 
254 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  33.6 
 
 
390 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
253 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
249 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  35.95 
 
 
464 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  34.41 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  31.4 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
390 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
391 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
391 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
392 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
390 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  29.88 
 
 
392 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.14 
 
 
239 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  31.28 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  29.58 
 
 
241 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  25.52 
 
 
227 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  37.78 
 
 
128 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  24.22 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  24.55 
 
 
248 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.7 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  28.83 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.56 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  26.32 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
288 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  25 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  24.58 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  27.34 
 
 
314 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  32 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.9 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  28.89 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.12 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.9 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  24.8 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  26.72 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  30.43 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  25.38 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  28.36 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  26.28 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.82 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  33.77 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  22.15 
 
 
631 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.9 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  28.26 
 
 
284 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
258 aa  42  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  24.82 
 
 
236 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  24.82 
 
 
236 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  24.82 
 
 
236 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>