More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 305 aa  589  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  39.78 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  38.35 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  31.92 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  27.95 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  38.68 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  39.05 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  44.95 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.76 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.67 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.67 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  34.71 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.96 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.7 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.91 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02165  TAM domain methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15860)  28.74 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475648  normal  0.123223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.25 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.51 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  36.75 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  32.81 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.11 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.65 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48517  predicted protein  30.56 
 
 		 403 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.6 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 400 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.36 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1696  hypothetical protein  26.72 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 250 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  36.44 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.86 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 390 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.65 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 208 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.21 
 
 		 420 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.36 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  34.75 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  31.91 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33.96 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  43.93 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  34.29 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.96 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  30.33 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1700  modification methylase NspV  35.48 
 
 		 484 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  32.41 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.65 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>