73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2724 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  94.98 
 
 		 239 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  77.41 
 
 		 239 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  45.34 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  32.14 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  36.36 
 
 		 464 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 327 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  30.92 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  27.53 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  32.78 
 
 		 390 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 390 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  29.72 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 398 aa  91.7  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 391 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 391 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 392 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  33.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  23.95 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  23.35 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  31.36 
 
 		 332 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 399 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  37.62 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  41.59 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  35.85 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.79 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  41.03 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  21.43 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  22.54 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  34.29 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  32.35 
 
 		 449 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  36.61 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  26.21 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.19 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.65 
 
 		 414 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  24.14 
 
 		 351 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.87 
 
 		 438 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  25.7 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 249 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 256 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 208 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 239 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.21 
 
 		 284 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.64 
 
 		 294 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>