More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1888 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 314 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  60.9 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  47.74 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.78 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  36.59 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  41.87 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  35.74 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.58 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  34.2 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  40.17 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  32.66 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  37.93 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.03 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  44.55 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35.07 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.53 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  40.54 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  35.24 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.07 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  37.67 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  35.19 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  34.35 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  30.94 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  37.17 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.59 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  38.94 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.14 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.66 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.5 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  36.11 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  33.1 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.39 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.58 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  30.72 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.91 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  25.98 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.32 
 
 		 263 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  28.5 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.07 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.48 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  30.09 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  33.9 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.58 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  39.64 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.51 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  35.58 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 361 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>