More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0966 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 392 aa  806    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 392 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  55.01 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  51.67 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  47.61 
 
 		 398 aa  362  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  34.58 
 
 		 250 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 253 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 249 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 254 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 249 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  32.08 
 
 		 264 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  29.88 
 
 		 256 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 261 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 250 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  28.92 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 247 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 239 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.79 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  31.18 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 173 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.19 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 129 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 117 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 		 183 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 135 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.45 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 121 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  40.3 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  34.95 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 113 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 342 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 342 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 343 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 342 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  42.67 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  36.08 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 131 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 136 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  33.7 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.09 
 
 		 135 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  30.84 
 
 		 129 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 155 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 125 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 154 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 146 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 122 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  48.21 
 
 		 122 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>