More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  48.89 
 
 		 249 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 234 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.5 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.39 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  36.89 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  34.96 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.9 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.9 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  35.16 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.99 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  29.71 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.93 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.45 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.6 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4130  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.442587  normal  0.0543283 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.83 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.6 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  29.17 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.6 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.6 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.6 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  34.38 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1003  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3929  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4594  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  33.83 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  34 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.08 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3620  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.065575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>