More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0714 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 142 aa  290  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  68.38 
 
 		 149 aa  196  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  70 
 
 		 146 aa  193  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  69.23 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  63.5 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  45.9 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  44.27 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  43.64 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.72 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  42.86 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  37.59 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  42.73 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  42.73 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.4 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  42.73 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  42.73 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  42.73 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  42.73 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  42.73 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  41.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.72 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  41.96 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  40.91 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
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NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  40.91 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  37.82 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
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NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  36.57 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.71 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.88 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  37.27 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.74 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  41.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  35.34 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  40.19 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  37.98 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  37.72 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36.04 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.45 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.87 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.09 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1995  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.414348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  35.4 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.06 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.85 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.34 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
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