More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4954 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  87.67 
 
 
146 aa  263  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  69.23 
 
 
142 aa  183  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  63.83 
 
 
149 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  62.32 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44 
 
 
128 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48.72 
 
 
132 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
130 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.87 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  46.15 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  46.15 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 
135 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.14 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  47.42 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  49.06 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  43.59 
 
 
132 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  44.23 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  44.23 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  45 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  46.39 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  46.39 
 
 
144 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  38.4 
 
 
135 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  45.36 
 
 
144 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  45.36 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
158 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
158 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
173 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
144 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.72 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  39.02 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  37.72 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.61 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.72 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.72 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.75 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  37.17 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  43.33 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.17 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.2 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  39.05 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  38.94 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  36.28 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  36.15 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  35.4 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  35.4 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  37.17 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
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NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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