More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2152 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 121 aa  243  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  58.62 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  62.62 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  57.76 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  52.68 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  53.39 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  47.27 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  48.7 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  49.56 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  45.22 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  44.34 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  44 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  44.14 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  43.27 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.9 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.26 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 249 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  46.05 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.4 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  32.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  38.94 
 
 		 449 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.36 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>