More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0059 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  97.76 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 136 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  37.59 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  36.84 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  38.35 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  38.35 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  37.59 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  37.59 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  36.84 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  36.84 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  36.84 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  37.4 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  36.09 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  36.84 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  37.4 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  36.84 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  36.84 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.35 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  37.9 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  37.69 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  32.82 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  37.78 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  38.35 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  39.85 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  37.98 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  38.97 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  38.97 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  38.97 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  38.97 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  38.35 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  37.59 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  37.78 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  35.04 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  35.43 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  35.43 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.59 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  34.88 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>