More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1062 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 112 aa  224  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  49 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  44.14 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  57.47 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  54.43 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  44.55 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  43.56 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  46.08 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  43.97 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  42.99 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  41.96 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  44.21 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  45.68 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  41.12 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  39.09 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.04 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  31.78 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  40.54 
 
 		 253 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  39.29 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  38.61 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 234 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 305 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>