More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1156 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  62.16 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  60.75 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  58.62 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  52.34 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  50.43 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  46.96 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  45.79 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  46.3 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  43.22 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  46.02 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  41.53 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  42.59 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  41.12 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  38.74 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  39.64 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  33.03 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  37.93 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  47.89 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9086  putative transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  36.63 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.86 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.86 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.86 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.86 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.86 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.86 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  33.94 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>