More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  46.85 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  46.02 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  46.3 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  43.22 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  42.73 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.94 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40.3 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0427  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  39.33 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  31.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  29.75 
 
 		 449 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.18 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>