More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2176 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 125 aa  253  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  62.16 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  59.81 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  62.62 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  55.75 
 
 		 125 aa  120  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  48.31 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  43.2 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  41.22 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  44.04 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  42.98 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  44.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  45.13 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  41.07 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  41.74 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  31.45 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  33.64 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.64 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  43.37 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  34.96 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.94 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.78 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.19 
 
 		 154 aa  57  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 267 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.19 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>