More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1319 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  60.34 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  53.23 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  53.66 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  49.19 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  55.36 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  52.25 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  41.23 
 
 		 449 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  37.4 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  37.07 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 255 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  40.37 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  33.62 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  38.39 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2511  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  41.57 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  36 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  33 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>