More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4290 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 130 aa  254  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  62.18 
 
 		 119 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  53.39 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  51.72 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  46.96 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  47.86 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  50.91 
 
 		 145 aa  95.9  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  49.56 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  46.9 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  46.02 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  44.17 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  44.25 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  43.8 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  48.65 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  47.22 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  52.94 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40.83 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  46.75 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.88 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  49.21 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 391 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  44.29 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 354 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  50.98 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>