More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5050 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 131 aa  259  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  55.97 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  48.92 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  51.72 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  48.7 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  50.98 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  42.24 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  45.22 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  46.02 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  41.88 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  43.56 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  43.56 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  45.13 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  42.98 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  43.56 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.67 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.67 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 339 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  47.37 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  37.17 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  49.25 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2524  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0506467  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 334 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 249 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 253 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  44.07 
 
 		 336 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>