More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2262 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  61.26 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  60.71 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  57.38 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  62 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  43 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  43.36 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  41.44 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  40.52 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  34.96 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2043  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6040  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  34.96 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  36.7 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  34.71 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 339 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  29.52 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  40.66 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  27.64 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.71 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>