More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6614 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  80.47 
 
 
128 aa  215  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  78.12 
 
 
128 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  80.33 
 
 
128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  79.51 
 
 
128 aa  209  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  79.51 
 
 
128 aa  209  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  75 
 
 
128 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  42.24 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03771  hypothetical protein  65.96 
 
 
60 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  29.73 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  40.4 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.36 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  33.91 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1995  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.414348  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  34.51 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.35 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.68 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
126 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  29.31 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  33.03 
 
 
342 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  32.69 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.61 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.65 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  32.11 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
342 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  30.61 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
343 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>