More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9141 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 124 aa  246  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  67.57 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  59.29 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  61.26 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  60.58 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  42 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  43.56 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  37.82 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  43.3 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6040  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  39 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.71 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  35.59 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  39 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  34.43 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.2 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>