More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0427 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0427  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0386  MerR family transcriptional regulator  93.06 
 
 
144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675924  normal  0.0916275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  56.74 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2480  MerR family transcriptional regulator  60.61 
 
 
151 aa  166  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  30.28 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  27.72 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  31.36 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.8 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  28.69 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  34.51 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.93 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 
334 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 
354 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 
213 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
140 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
152 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
145 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
145 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 
152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  28.06 
 
 
158 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
135 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
144 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 
152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  32.52 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  28.68 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  33.64 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  29.84 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.58 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  32.65 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  34.55 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  32.31 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  40.58 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
252 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
336 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>