More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0052 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
157 aa  313  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  28.17 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  43.66 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  35.78 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.65 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  44.16 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
252 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 
254 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
258 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
251 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 
252 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 
252 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
320 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  40.24 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  39.68 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
288 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 
295 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35 
 
 
262 aa  57.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  36.99 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 
303 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1582  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
253 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 
319 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
256 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.79 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
283 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
251 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
255 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  29.8 
 
 
255 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>