More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1034 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  298  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  35.09 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  29.9 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  35.35 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 190 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  32.74 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  28.03 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  30.97 
 
 		 449 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  26.96 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  34.21 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  34.21 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  25.34 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  27.52 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  27.35 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  32.08 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0138  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  29.73 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0130  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  31.31 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  27.78 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  31.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30 
 
 		 252 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>