More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  52.25 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  53.21 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  45.87 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  44.14 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  45.37 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  46.79 
 
 		 129 aa  103  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  39.45 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  39.25 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  37.38 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  37.84 
 
 		 491 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 198 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 79 aa  67  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.48 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  27.59 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 255 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  30.97 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  35.59 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>