More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3923 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 156 aa  324  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  49.26 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  31.62 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  28.8 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  31.93 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl251  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000105491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl171  MerR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  29.03 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  29.17 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  25.21 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  28.46 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.93 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 449 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>