More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0427 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
129 aa  262  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  47.58 
 
 
129 aa  128  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  45.53 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
128 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  45.16 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  45.53 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 
129 aa  114  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  44.55 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  36.13 
 
 
138 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
138 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  52.7 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  35.45 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl171  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  30.36 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  31.58 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  28.1 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  33.64 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  28.7 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.51 
 
 
154 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  31.62 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.51 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.51 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.51 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.51 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.03 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  27.68 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
449 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>