More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2231 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  40.68 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  40.34 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 129 aa  85.9  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  34.86 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  27.94 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.81 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 164 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 164 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 164 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  27.61 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  35.37 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  29.31 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  27.93 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  26.05 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  26.85 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  26.85 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  26.85 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  30.16 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  27.03 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  22.6 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  25.2 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  28.43 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  31.96 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  25.41 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  25.41 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl251  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000105491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  25.2 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>