More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  310  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  49.26 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  41.91 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  43.8 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  36.69 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  37.19 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  46.07 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  31.15 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  32.77 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  29.86 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  28.33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  32.76 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl251  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000105491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl171  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  33.01 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  25.56 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  33.01 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  27.73 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  26.45 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  29.46 
 
 		 449 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  30.61 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  32.32 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  24 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  25.2 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  27.41 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  27.35 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  27.35 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  31.07 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>