More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2072 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  163  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  40.79 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.59 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  41.67 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  38.89 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  37.33 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  36.23 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  29.87 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  35.06 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 173 aa  57  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  37.18 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  29.11 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>