More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 150 aa  293  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  45.3 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 255 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  43.33 
 
 		 449 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 190 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  44.21 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  33.62 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  42.74 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  37.27 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  43.43 
 
 		 491 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  36.11 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  39.44 
 
 		 284 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  33.78 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  29 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  24.39 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  39.42 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  25.78 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 319 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2511  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.240301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>