More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0264 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 181 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  39.77 
 
 		 191 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  37.87 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 343 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 391 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  36.79 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.95 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  31.17 
 
 		 390 aa  67.4  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 253 aa  67.4  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30.77 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  26.06 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 648 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  33.04 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  28.78 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 342 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 258 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  26.51 
 
 		 278 aa  60.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  27.88 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  24.48 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  28.67 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  33.64 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.53 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.44 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.34 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  40.3 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  34.38 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 343 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>